המשרד להגנת הסביבה הטיל עיצום כספי בסך 1,630,960 שקל על חברת אפיקים שירותי תחבורה מתקדמים. הקנס הוטל על החברה בגין שלוש הפרות נפרדות של ההוראות למניעה ולצמצום זיהום אוויר מציי רכב כבד מתוקף חוק אוויר נקי, תשס"ח 2008.

בביקורת שערכו בחברה מפקחי היחידה למניעת זיהום אוויר מתחבורה במשרד להגנת הסביבה נמצא, כי יש ברשות החברה 12 כלי רכב כבדים (אוטובוסים) מתקן יורו 2, תקן ישן ומזהם שהחזקתו מנוגדת להוראות. בכך, לטענת המשרד, תרמה החברה באופן שיטתי לזיהום האוויר באזורים מאוכלסים. בנוסף, במועד הביקורת החברה לא הכשירה את כל 800 נהגיה לנהיגה חסכונית, כנדרש בהוראות. נהיגה נכונה וחסכונית יכולה לחסוך עד 15% מפליטת הזיהום מהאוטובוסים.

עוד נקבע כי למרות המצוין בהוראות, חברת אפיקים לא הגישה למשרד להגנת הסביבה בזמן את הדוח השנתי, הכולל מידע ונתונים מדויקים על מספר כלי הרכב שברשותה לפי תקן יורו; חישוב פליטת חלקיקים ממוצעת מכלל כלי הרכב בצי; סיכום של פניות הציבור שהתקבלו בנושא עשן; סיכום נתונים בדבר ביצוע הכשרה לנהיגה חסכונית.

בעקבות חוסר הדיווח, ניתן לחברה ארכה להגשת הדוח אך למרות זאת, ולמרות ההתראות – החברה הגישה את הדוח באיחור של כשנה. יתרה מכך, החברה לא העמידה לעיון הציבור את הדוחות השנתיים שלה ולא פרסמה אותם באתר האינטרנט שלה כמתחייב מההוראה. "בשל כל הנסיבות, הטיל יצחק בן דוד, סמנכ"ל בכיר לפיקוח ואכיפה במשרד להגנת הסביבה את העיצום הכספי על החברה", נמסר מהמשרד להגנת הסביבה.